UV-järjestelmän talous määräytyy seuraavien tekijöiden perusteella: laitteiden kustannukset ja käyttöiän; sähkötehokkuus; sterilointivaikutuksen väheneminen käytön aikana; sähkökustannukset jne. Ultraviolettidesinfiointijärjestelmän taloudellisessa analyysissä ei ole vielä päästy lopputulokseen. On monia analyysiraportteja, joissa on erilaisia johtopäätöksiä. On mielipiteitä, että ultraviolettidesinfiointilaite kuluttaa paljon sähköä, ja laitteiden huolto ja kustannukset ovat korkeat. Suurten järjestelmien osalta laiteinvestoinnit ovat suuremmat kuin otsonijärjestelmän, ja käyttökustannukset ovat samanlaiset kuin otsonin; Mutta pienessä puhtaan veden tuotantojärjestelmässä investointi on pienempi kuin otsonilaitteen. On myös olemassa mielipiteitä siitä, että UV-desinfiointijärjestelmän investointi- ja käyttökustannukset ovat erittäin edulliset tuhansien tonnien päiväkäsittelyasteikolla, joka on paljon alhaisempi kuin kloorauksen ja otsonin desinfioinnin kustannukset. On esimerkiksi olemassa analyyttisiä tietoja siitä, että rakennettäessä pientä juomavedenpuhdistamoa, jonka asukasluku on 10–25 000, ultravioletti-, klooridioksidi- ja otsonin desinfiointikustannusten arvioitu suhde on 1:4: (8-9), väestölle, joka on suurempi kuin 500 000 sosiaalijärjestölle, kustannussuhde on noin 1:2.5:2.5.
Näihin kustannusarvioihin eivät sisälly lisäkustannukset desinfioinnin sivutuotteiden ja cryptosporidium-kystojen poistamisesta käytettäessä muita kuin UV-desinfiointiprosesseja. Lisäksi analyysitiedot osoittavat, että ultraviolettidesinfiointiin liittyvät investointi- ja käyttökustannukset ovat pienemmät kuin kloorin desinfioinnin, ja desinfiointikustannukset ovat noin puolet kloorin kustannuksista, mutta ero pienenee vedenkäsittelyasteikon laajenemisen myötä.
Ranskassa ja entisessä Neuvostoliitossa ultraviolettien desinfiointi rajoittui pieniin laitteisiin. Perustettujen suurten laitteiden oli määrä asentaa ultraviolettilamput sarjaan suodatetun veden verkkovirtaan. Yhdysvalloissa ultraviolettidesinfiointi rajoittuu myös pieniin laitteisiin ja uima-altaisiin, ja se yhdistetään usein muihin desinfiointiaiteisiin. Käytännön sovelluksissa on kuitenkin raportoitu, että ultraviolettidesinfiointia käyttävien juomavesilaitosten mittakaava on ylittänyt 1,5 miljoonaa tonnia päivässä.